Gipuzkoa Basket nació en los primeros días del mes de mayo de 2001. La Diputación Foral de Gipuzkoa propuso a Miguel Santos encabezar un proyecto nuevo de baloncesto en Gipuzkoa. Miguel Santos reunió a un grupo de 25 personas, entre las que estaban antiguos jugadores, entrenadores y directivos del baloncesto gipuzcoano, además de otras personas vinculadas con el mundo empresarial, que sin conocer los entresijos de este deporte, decidieron incorporarse rápidamente a esta plataforma deportiva. En breves días se perfiló un proyecto y los pasos se fueron dando hasta crear el club Donostiako Gipuzkoa Basket.

Las instituciones (Diputación Foral y Ayuntamiento de Donostia San Sebastián) creyeron en este proyecto y lo apoyaron desde el principio. Con estas garantías, Gipuzkoa Basket solicitó la plaza en la liga LEB-2 a la Federación Española, que fue adjudicada el 4 de julio de 2001. El día 30 de julio significó un hito en la historia del club. Tras varias gestiones, la empresa Datac Computer decidió apostar por Gipuzkoa Basket y dar nombre al equipo abriendo un camino esperanzador.

Tras una temporada en que la parte deportiva transcurrió con total normalidad, la directiva de Gipuzkoa Basket decide retirarse de la competición al no cumplirse los compromisos económicos que permitieran consolidar un proyecto de futuro ilusionante. Tras dos años en los que el club no tuvo ningún equipo representado en la competición, Gipuzkoa Basket consiguió vertebrar todos los pilares para consolidar éste.

El compromiso a largo plazo de un patrocinador principal, la empresa constructora Grupo Bruesa, el apoyo de la Diputación Foral de Gipuzkoa y de otros patrocinadores y colaboradores del club hicieron posible que en la temporada 2004-2005 Gipuzkoa volviese a tener un equipo en la liga LEB-2. La temporada 2004-2005 fue un éxito tanto en lo social, como en lo deportivo, llegando a jugar el play off de ascenso a la Liga LEB. En la temporada 2005-2006, y tras la compra de la plaza, avalada por toda la junta directiva del Club, el equipo compite en la Liga LEB.